该工程始于2002年，该协会利用“基因芯片”技术从来自大约1200个家庭的孤独症患者中寻找遗传上的相似之处。他们还对患者的DNA进行了扫描，期望找出变异。

研究人员发现了neurexin1，部分患者拥有这种与神经传递素谷氨酸一起作用的基因，而先前就已经有研究证明它与孤独症有关。他们还在11号染色体上找到了一种基因，这种基因也可能与孤独症易感性有关。但这种基因还未被确认。研究人员推测，可能有5到6种重要的基因和多达30种其他的基因与孤独症有关。如果一个小孩携带有这些基因的话，那么他可能生来就患孤独症或一种更严重的疾病的几率会更高。